Projekty współfinansowane ze środków Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego w ramach Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka:

Tytuł: Centrum biotechnologii produktów leczniczych. Pakiet innowacyjnych biofarmaceutyków dla terapii i profilaktyki ludzi i zwierząt
Beneficjent: Instytut Biotechnologii i Antybiotyków
Wartość projektu: 89 739 098,05 PLN (IBB PAN - 7 953 620,06 PLN)
Udział Unii Europejskiej: 76 278 233,34 PLN (IBB PAN - 6 760 577,05 PLN)
Okres realizacji: 01.03.2008-31.12.2011
Numer umowy: POIG.01.01.02-00-007/08
Projekt współfinansowany przez Unię Europejską z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego

Tytuł: Optymalizacja charakterystyki i przygotowania preparatów fagowych do celów terapeutycznych
Beneficjent: Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalenj PAN im. Ludwika Hirszfelda
Wartość projektu: 13 660 000 PLN (IBB PAN - 6 576 000 PLN)
Udział Unii Europejskiej: 11 611 000 PLN (IBB PAN - 5 589 600 PLN)
Okres realizacji: 01.03.2008-30.04.2012
Numer umowy: POIG.01.03.01-00-003/08
Projekt współfinansowany przez Unię Europejską z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego

Tytuł: Zastosowanie pochodnych poliizoprenoidów jako nośników leków i regulatorów metabolizmu
Beneficjent: Instytut Biochemii i Biofizyki PAN
Wartość projektu: 5 000 000 PLN
Udział Unii Europejskiej: 4 250 000 PLN
Okres realizacji: 01.01.2010-31.01.2014
Numer umowy: UDA-POIG.01.03.01-14-036/09-00
Projekt współfinansowany przez Unię Europejską z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego

Tytuł: Inżynierowanie szczepów Trichoderma o wzmocnionych właściwościach biokontrolnych
Beneficjent: Instytut Biochemii i Biofizyki PAN
Wartość projektu: 3 153 855 PLN
Udział Unii Europejskiej: 2 680 776,75 PLN
Okres realizacji: 01.03.2009-31.12.2012
Numer umowy: UDA-POIG.01.03.01-14-038/09-00
Projekt współfinansowany przez Unię Europejską z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego

Tytuł: Biocentrum Ochota - infrastruktura informatyczna dla rozwoju strategicznych kierunków biologii i medycyny
Beneficjent: Instytut Biochemii i Biofizyki PAN
Wartość projektu: 26 530 185,40 PLN
Udział Unii Europejskiej: 22 550 657,59 PLN
Okres realizacji: 01.04.2009-30.09.2013
Numer umowy: POIG.02.03.00-00-003/09-00
Projekt współfinansowany przez Unię Europejską z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego

Tytuł: Opracowanie metody wykrywania markerów wskazujących na predyspozycję do rozwoju insulinooporności
Beneficjent: Uniwersytet Medyczny w Białymstoku
Wartość projektu: 20 011 918,66 PLN (IBB PAN - 3 760 040 PLN)
Udział Unii Europejskiej: 17 010 130,86 PLN (IBB PAN - 3 196 034 PLN)
Okres realizacji: 01.04.2009-10.07.2014
Numer umowy: POIG.01.03.01-00-128/08-00
Projekt współfinansowany przez Unię Europejską z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego

Tytuł: Macromolecular assemblies involved in RNA metabolism
Beneficjent: Instytut Biochemii i Biofizyki PAN
Wartość projektu: 2 184 000 PLN
Udział Unii Europejskiej: 1 856 400 PLN
Okres realizacji: 01.06.2009-31.05.2013
Numer umowy: TEAM/2008-2/1
Projekt współfinansowany przez Unię Europejską z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego

Tytuł: Platforma informatyczna baz danych dla efektywnego wykorzystania wyników prac badawczych
Beneficjent: Fundacja Partnerstwa Technologicznego Technology Partners
Wartość projektu: 5 974 155 PLN (IBB PAN - 198 288 PLN)
Udział Unii Europejskiej: 5 078 031,75 PLN (IBB PAN - 168 544,80 PLN)
Okres realizacji: 01.10.2009-31.08.2012
Numer umowy: POIG.02.03.02-00-022/09
Projekt współfinansowany przez Unię Europejską z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego

Tytuł:Elektrochemiczne bioczujniki do detekcji aktywacji receptorów RAGE – narzędzia taniej teranostyki
Beneficjent: Instytut Biochemii i Biofizyki PAN
Wartość projektu: 3 471 281,79 PLN
Udział Unii Europejskiej: 2 950 589,52 PLN
Okres realizacji: 01.04.2009-31.12.2013
Numer umowy: POIG.01.01.02-00-048/09-00
Projekt współfinansowany przez Unię Europejską z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego

Tytuł: Metagenomy jako źródło nowoczesnych narzędzi biotechnologicznych służących do bioremediacji i biotransformacji
Beneficjent: Instytut Biochemii i Biofizyki PAN
Wartość projektu: 15 225 200,27 PLN
Udział Unii Europejskiej: 12 941 420,22 PLN
Okres realizacji: 01.04.2009-31.12.2014
Numer umowy: POIG.01.01.02-14-054/09-00
Projekt współfinansowany przez Unię Europejską z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego

Tytuł: Krajowe Laboratorium Multidyscyplinarne Nanomateriałów Funkcjonalnych
Beneficjent: Uniwersytet Warszawski
Wartość projektu: 54 135 857,08 PLN (IBB PAN - 5 528 000 PLN)
Udział Unii Europejskiej: 46 015 478,51 PLN (IBB PAN - 4 698 800 PLN)
Okres realizacji: 06.08.2008-31.12.2013
Numer umowy: POIGT.02.02.00-00-025/09-00
Projekt współfinansowany przez Unię Europejską z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego

Tytuł: Centrum Badań Przedklinicznych i Technologii
Beneficjent: Warszawski Uniwersytet Medyczny
Wartość projektu: 388 444 071,00 PLN (IBB PAN - 32 553 524 PLN)
Udział Unii Europejskiej: 305 447 500 PLN (IBB PAN - 23 085 722,05 PLN)
Okres realizacji: 01.01.2008-31.03.2013
Numer umowy: POIG.02.02.00-14-024/08-00
Projekt współfinansowany przez Unię Europejską z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego

Tytuł: Międzynarodowe Studia Doktoranckie w zakresie biologii molekularnej: DNA, RNA i białka – od badań podstawowych do aplikacyjnych
Beneficjent: Instytut Biochemii i Biofizyki PAN
Wartość projektu: 6 293 000 PLN
Udział Unii Europejskiej: 5 349 050 PLN
Okres realizacji: 01.04.2010-31.01.2015
Numer umowy: MPD/2009-3/2
Międzynarodowe Studia Doktoranckie (MPD) to jeden z programów realizowanych przez Fundację na rzecz Nauki Polskiej.
http://www.fnp.org.pl/programy/aktualne_programy_fnp
Program stanowi 19 projektów eksperymentalnych, które będą realizowane w Instytucie Biochemii i Biofizyki (IBB) lub w Międzynarodowym Instytucie Biologii Molekularnej i Komórkowej (IIMCB). Każdy z projektów na przypisanego promotora z IBB bądź z IIMCB oraz współpracujące laboratorium zagraniczne, w którym doktorant spędzi 6-24 miesięcy w ciągu czterech lat.
Zakres tematyczny projektów obejmuje cztery kategorie:
Dokładny opis projektów oraz pracowni, w których nastąpi ich realizacja, jest dostępny na stronie internetowej http://www.ibb.waw.pl/molbiophd
Projekt współfinansowany przez Unię Europejską z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego
Tytuł: Metal-dependent peptide hydrolysis. Tools and mechanisms for biotechnology, toxicology and supramolecular chemistry
Beneficjent: Instytut Biochemii i Biofizyki PAN
Wartość projektu: 2 947 333 PLN
Udział Unii Europejskiej: 2 505 233,05 PLN
Okres realizacji: 01.05.2010-30.04.2014
Numer umowy: TEAM/2009-4/1
Projekt dotyczy biotechnologicznych i toksykologicznych aspektów zależnej od jonów metali swoistej sekwencyjnie reakcji hydrolizy wiązania peptydowego. Proces hydrolizy, który charakteryzuje się absolutną selektywnością dla wąskiej klasy sekwencji peptydowych, znajduje zastosowania biotechnologiczne, m. in. w usprawnianiu procedur oczyszczania białek rekombinowanych. Innym aspektem projektu jest identyfikacja i zbadanie na poziomie molekularnym reaktywności procesów toksycznych, związanych z niepożądaną hydrolizą w obrębie szczególnych domen białkowych, zwłaszcza palców cynkowych. Drugim przedmiotem zainteresowania projektu jest analiza reaktywności rodziny produktów reakcji hydrolizy, płaskich kompleksów jonów metali aktywnych hydrolitycznie. Kompleksy te z jednej strony aktywują i generują reaktywne formy tlenowe, stanowiąc potencjalne toksyny wewnątrzkomórkowe, a z drugiej mogą służyć jako elementy konstrukcyjno-katalityczne dla chemii supramolekularnej.
Szczegółowe informacje o projekcie dostępne są na stronie: http://www.ibb.waw.pl/~balgroup/team/?project,9
Program został uruchomiony dzięki pozyskaniu przez Fundację środków z funduszy europejskich w ramach Działania 1.2 "Wzmocnienie potencjału kadrowego nauki" Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka 2007-2013
Tytuł: The AlkB protein and its eukaryotic homologues - the role in DNA repair and the possible role in cancer etiology and target in cancer therapy
Beneficjent: Instytut Biochemii i Biofizyki PAN
Partner: Rikshospitalet University Hospital HF
Wartość projektu: 838 000 EUR
Udział Polsko-Norweskiego Funduszu Badań Naukowych: 750 000 EUR
Okres realizacji: 01.07.2008-31.12.2010
Numer umowy: PNRF-143-AI-1/07
Czynniki alkilujące pochodzenia endogennego i egzogennego powodują różnorodne uszkodzenia DNA, które inicjują mutagenezę, karcinogenezę, stany zapalne i procesy starzenia. Aby utrzymywać integralność DNA żywe komórki posiadają różnorodne systemy obronne, których celem jest naprawa uszkodzeń w DNA. Wśród tych systemów naprawczych, bezpośrednia dealkilacja za pośrednictwem AlkB jest jedną z najprostszych i najbardziej efektywnych dróg naprawy uszkodzeń alkilacyjnych. Udział genu alkB w naprawie DNA postulowano już ponad 20 lat temu, jednak molekularne podstawy działania białka AlkB wyjaśniono dopiero niedawno. Dlatego też, w przeciwieństwie do innych systemów naprawy DNA, bezpośrednia naprawa przez dioksygenazy typu AlkB jest ciągle w niewystarczającym stopniu zbadana, szczególnie w odniesieniu do możliwego spektrum substratów, ekspresji w różnych organizmach (szczególnie eukariotycznych) i tkankach (również porównanie tkanki nowotworowej i zdrowej), oddziaływań z innymi systemami naprawy, metod pomiaru aktywności, etc. W konsekwencji, Polsko-Norweska grupa planuje przeprowadzenie szeregu badań, których wyniki powiększą naszą wiedzę na temat roli biologicznej białek typu AlkB. Dodatkowo, obok kontynuacji badań nad ludzkimi i mysimi homologami bakteryjnego białka AlkB, podejmiemy badania nad innymi gatunkami eukariotycznymi, gdzie homologiczne sekwencje DNA zostały znalezione. Gatunkami tymi będą drożdże S. pombe i nicień C.
elegans. Przypuszczamy, że homologi AlkB u organizmów wyższych odgrywają ważną rolę w naprawie adduktów generowanych przez produkty peroksydacji lipidów i będziemy badać te addukty jako możliwe substraty AlkB. Ponieważ alkilacyjne uszkodzenia DNA są generowane przez niektóre chemoterapeutyki przeciwnowotworowe, zamierzamy badać rolę naprawy DNA typu AlkB w wyjaśnieniu toksyczności tych chemoterapeutyków aby określić nowe markery diagnostyczne i cele terapeutyczne.
Odkryliśmy, że hABH3, ludzki homolog bakteryjnego AlkB, pełni istotną rolę w zapobieganiu akumulacji metylowanych mRNA i prawdopodobnie w konsekwencji nieprawidłowych białek, dlatego też będziemy badać rolę hABH3 w prewencji chorób neurodegeneracyjnych związanych z akumulacją agregatów tworzonych przez nieprawidłowe białka. W ramach projektu spróbujemy ustalić udział białek szoku cieplnego w procesach naprawy DNA/RNA i ochrony białek naprawy DNA/RNA, w tym
homologów AlkB. Zbadamy możliwe modyfikacje posttranslacyjne homologów AlkB. Mimo, iż główny cel naszych badań, wyjaśnienie roli białek typu AlkB w różnych aspektach ochrony integralności DNA i RNA jest naukowy, to wnioski płynące z wyników naszych badań będą miały znaczenie dla rozwoju nowych terapii przeciwnowotworowych.