Lista wykładów

 

 

 

 

Biophysics for Biologists (B4B),

room E, 09:00

Structure and organization of matter - basic information

 

1. 8.10.2018   

Andrzej Dziembowski, IBB PAS/University of Warsaw

Biophysical analysis of biological macromolecules starts with the biochemistry– an introduction

 

2. 15.10.2018  

Jarosław Poznański, IBB PAS

Without a basic knowledge about properties of macromolecules, a biologist will be unable to conduct a biophysical experiment – an introduction

 

Optical methods:

 

3. 22.10.2018

Wojciech Bal, IBB PAS

What's there between physics and biology?

UV-VIS and CD spectroscopy in biology

 

4. 5.11.2018  

Jacek Waluk, IFCh PAS

Fluorescence, Raman, and IR spectroscopies

 

 

Thermodynamic methods:

 

5. 19.11.2018   

Tomasz Frączyk, Medical University of Warsaw 

Isothermal titration calorimetry (ITC) and differential scanning calorimetry (DSC)

 

6. 26.11.2018

Jaroslaw Poznanski, IBB PAS

Thermal shift assay (former DSF - Differential Scanning Fluorimetry) and Microscale thermophoresis (MST) – fast and efficient methods for screening intermolecular interactions 

 

7. 3.12.2018  

Krzysztof Skowronek, IICMB, Warsaw 

Surface Plasmon Resonance. Real-time stain-free interaction analysis

 

Structural methods:


8. 10.12.2018  

Honorata Czapinska / Matthias Bochtler, IICMB/IBB PAS, Warsaw

Macromolecular crystallography

 

9. 17.12.2018  

Konrad Zdanowski, IBB PAS/University of Natural Sciences and Humanities, Siedlce

Adventures with NMR spectroscopy of proteins and smaller molecules

 

10. 7.01.2019 

Simon Drew, IBB PAS/University of Melbourne

Electron paramagnetic resonance – Principles and applications to chemical and biological systems

 

 

11. 14.01.2019 

Marcin Nowotny, IICMB, Warsaw

Cryo-electron microscopy - revolution in structural biology

 

12. 21.01.2019 

Michał Dadlez, IBB PAS

Mass spectrometry in structure and dynamics studies of proteins and their complexes 

 

13. 28.01.2019 

Maciej Kozak, UAM Poznan

Applications of SAXS in biophysics and structural biology

 

14. 11.02.2019 

Piotr Zielenkiewicz, IBB PAS

Molecular modeling 

 

15. 18.02.2019

Małgorzata Lichocka, IBB PAS

Imaging Molecular Interactions in Living Cells

 

 


 

Applied Molecular Biology, room E, 09:00

 

19.03.2018 

Magdalena Kowalczyk, Jacek Bardowski, Agnieszka Szczepankowska 

Lactic acid bacteria - from basic research to innovative applications. 

 

9.04.2018 

Róża Kucharczyk

ATP synthase defects in diseases – what we have learnt from yeast model

 

16.04.2018 

Barbara Tudek

Molecular markers for cancer diagnosis and selection of anticancer therapy

 

23.04.2018 

Magdalena Krzymowska, Jacek Hennig 

Molecular breeding

 

14.05.2018 

Jan Gawor

Advances in genome sequencing technologies

 

21.05.2018 

Mirosław Tyrka

Next Generation Sequencing technologies for gene discovery

 

28.05.2018 

Beata Burzyńska

Transcriptomic biomarkers of cardiovascular disease

 

4.06.2018 

Małgorzata Łobocka

Progress in the engineering of bacterial and bacteriophage genomes and in the construction of artificial life

 

Exam planned on June 11, 2018, hall E

 

 

 


 

Program wykładów semestr zimowy 2017/2018

 

Biologia molekularna eukariontów – nowe odkrycia i trendy badawcze”

sala E, godz. 9:00

  

 

Temat

Osoba prowadząca

data

Dynamika struktury chromatyny: modyfikacje histonów

Dr hab. Marta Koblowska

02.10.2017

Dynamika struktury chromatyny: kompleksy remodulujące 

Dr hab. Tomasz Sarnowski 

09.10.2017

Replikacja DNA/cykl komórkowy

Prof. Iwona Fijałkowska/Dr Michał Dmowski/ Dr Karolina Makieła-Dzbeńska

16.10.2017

Stabilność genomu, reperacja DNA

Dr hab. Adrianna Skoneczna

23.10.2017

Transkrypcja z udziałem Pol II; mRNA versus lncRNA

Dr Szymon Świeżewski

06.11.2017

Splicing mRNA

Prof. Magda Konarska

13.11.2017

Transkrypcja z udziałem Pol III, procesowanie tRNA

Prof. Magdalena Boguta/ Dr Damian Graczyk

20.11.2017

Inne RNA, transkrypcja i procesowanie

Prof. Joanna Kufel

27.11.2017

Małe regulatorowe RNA

Prof. Andrzej Dziembowski

04.12.2017

Trwałość RNA

Prof. Andrzej Dziembowski

11.12.2017

Translacja białek

Prof. Marek Tchórzewski

08.01.2017

Ubikwitynacja i degradacja białek

Prof. Teresa Żołądek

15.01.2017

Autofagia

Prof. Agnieszka Sirko

22.01.2017

Transport białek w komórce

Dr Joanna Kamińska

29.01.2017

Fosforylacja białek

Prof. Grażyna Dobrowolska

05.02.2017

 

Inne modyfikacje postranslacyjne białek - lipidacja

Prof. Ewa Świeżewska/Dr Małgorzata Gutkowska-Stronkowska

12.02.2017

Cykl wykładów zakończy sie egzaminem

 

 

Program wykładów semestr zimowy 2016/2017

 

„Patologia molekularna wybranych chorób genetycznie uwarunkowanych” 

(Zakład Genetyki Medycznej Instytutu Matki i Dziecka)

 

Wykłady odbędą się w sali E, godz. 10:00

TematOsoba prowadzącaLiczba godzin data
Test genetycznyProf. J. Bal117.10.16
Znaczenie diagnostyki chorób genetycznych oraz poradnictwa genetycznego we współczesnej medycynieDr E. Obersztyn117.10.16
Zasady i metody klasycznej i molekularnej diagnostyki cytogenetycznejDr B. Nowakowska224.10.16
Zespoły chorobowe zależne od aberracji lub niestabilności chromosomówDr B. Nowakowska207.11.16
Diagnostyka molekularna chorób dziedzicznych - metody i interpretacja wyników badańDr  M. Gos214.11.16
Mukowiscydoza – modelowa choroba dziedzicznaMgr D. Śniegórska121.11.16
Aspekty genetyczne dziedzicznej postaci głuchotyMgr K. Niepokój121.11.16
Jedna choroba wiele genów – RASopatie jako przykład heterogenności genetycznej Dr M. Gos 228.11.16
Jeden gen trzy fenoptypy – mutacja dynamiczna w genie FMR1Dr S. Rzońca205.12.16
Wielogenowe podłoże genodermatoz na przykładzie Epidermolisis bullosa – choroby „dzieci motyli”. Od diagnostyki do terapiiDr K. Wertheim-Tysarowska212.12.16
Rola rodzicielskiego piętna genomowego w etiopatogenezie chorób genetycznie uwarunkowanych. Dr M. Gos219.12.16
Rekombinacja niehomologiczna jako przyczyna rdzeniowego zaniku mięśniDr M. Gos109.01.17
Poszukiwanie, przy zastosowaniu technik molekularnych, genów i ich wariantów odpowiedzialnych za wystąpienie wad migracji neuronalnychDr. P. Gawliński109.01.17
Niepełnosprawność intelektualna – stan badań a możliwości diagnostyki molekularnejDr A. Charzewska216.01.17
Zespoły padaczkowe. Geneza podłoże molekularneDr D. Hoffman-Zacharska 123.01.17
Choroby neurodegeracyjne o późnym wieku zachorowania Dr D. Hoffman-Zacharska 123.01.17
Problemy etyczne diagnostyki chorób genetycznychDr D. Hoffman-Zacharska 130.01.17

Test z wykładów - 30.01.2017

Materiały do wykładów: 

a) diagnostyka molekularna

b) Zespół łamliwego chromosomu X

c) Heterogenność genetyczna

d) Pęcherzowe odrdzielanie się naskórka

e) Metody analizy DNA

f) Metody analizy DNA cz. II

g) Mukowiscytoza

h) Neurofibromina

i) Neurofibromina 2

j) Piętnowanie

k) Rasopatie

l) Aspekty genetyczne dziedzicznej postaci niedosłuchu

m) Rekombinacja niehomologiczna jako przyczyna rdzeniowego zaniku mięśni

n) Analiza genetyczna dziedzicznych chorób metabolicznych

o) Niepełnosprawność intelektualna

p) Zasady i metody ....

r) Zespoły chorobowe ....

s) Zespoły padaczkowe

 

Wykłady, 2015/2016

Semestr letni:

 

22.01.2016, godz. 16:00 sala 7 - Prof. dr hab. J.M. Bujnicki "Computational modeling of protein and RNA structures" 

07.03.2016, godz. 13:00, MIBMiK - Prof. Agnieszka Chacinska

21.03.2016, godz. 13:00, MIBMiK - Dr hab. Marcin Nowotny - "CRISPR - mechanism and applications"

04.04.2016, godz. 13:00, MIBMiK - Prof. Jacek Kuznicki - "Calcium in health and brain diseases - part 1"

11.04.2016, godz. 13:00, MIBMiK - Prof. Jacek Kuznicki - "Calcium in health and brain diseases - part 2"

18.04.2016, godz. 13:00, MIBMiK prof. Jacek Jaworski - "Cytoskeleton dynamics and cytoskeleton based transport"

25.04.2016, godz. 13:00, MIBMiK - prof. Jacek Jaworski - "Cytoskeleton dynamics and cytoskeleton based transport"

09.05.2016, godz. 13:00, MIBMiK - Prof. Marta Miaczynska - "Basic principles of intracellular membrane trafficking"

16.05.2016, godz. 13:00, MIBMiK - Prof. Marta Miaczynska - "Endocytosis: mechanisms and functions"

23.05.2016, godz. 13:00, MIBMiK - Marcin Nowotny - "Modern methods of single particle electron microscopy"

 

Semest zimowy

"Introduction to macro-molecular crystallography "

Prowadzący prof. Matthias Bochtler

 

November 16th, 9:30  Introduction to high resolution structure determination methods, diffraction based methods in particular

November 16th, 10:30  Crystal growth, crystal symmetry, Bravais lattices, space groups

 

November 23rd, 9:30  Diffraction physics, determining Bravais lattice and space group from diffraction data

November 23rd, 10:30 Data integration and scaling

 

November 30th, 9:30  Reciprocal space, Fourier transforms, experimental phasing

November 30th, 10:30: Molecular replacement

 

December 14th, 9:30  Model building and refinement

December 14th, 10:30 Data validation, data deposition

 

"Zastosowanie sekwencjonowań nowej generacji w badaniach naukowych"

czas trwania: poniedziałek 25.05.-22.06.2015

Sala E

 

1. Mgr Jan Gawor  - "Strategie sekwencjonowania małych genomów" (25.05.2015, g.12:00)

2. Dr Rafał Archacki - "Real-time PCR" (01.06.2015, g.12:00)

3. Mgr Anna Fogtman IBB PAN - "RNA-seq, ChIP-seq"  (08.06.2015, g. 12:30)

3. Dr Bartłomiej Wilczynski - "Analiza danych z Sekwencjonowania RNA-seq" (15.06.2015, g. 11:30)

4. Dr Bartłomiej Wilczynski - "Analiza danych z Chipseq" (22.06.2015, g.12:00)

 

 

"Bioenergetyka komórki ssaczej" 

czas trwania: poniedziałek 09.03.-27.04.2015

Sala E, godz. 12:00

 

Program wykładów:

 

1. Profesor Lech Wojtczak - „Historia badan nad mitochondriami, struktura mitochondriów i oksydacyjna fosforylacja”,

2. Dr hab. Joanna Szczepanowska - „Stres mitochondrialny w starzeniu i chorobach neurodegeneracyjnych”,

3. Dr hab Mariusz Wieckowski  - "Oddzialywania mitochondriów z innymi strukturami wewnątrzkomorkowymi i rola tych        oddzialywan w przekazywaniu sygnału”,

4. Dr Magdalena Lebiedzinska-Arciszewska - „ Apoptoza i mitoptoza”.

5. Dr Michal Wasilewski - "Biogeneza i homeostaza mitochondriów"

6. Profesor Agnieszka Chacinska - "Mitochondria jako centra komunikacyjne"

 

 

 

Metody wielkoskalowe (genomiczne, transkryptomiczne i proteomiczne) w badaniach podstawowych i aplikacyjnych


Czas trwania: poniedziałek od 13.10.2014 do 01.12.2014

Sala E, godz. 14:00

Program seminarium