Lista wykładów
Bioinorganic Chemistry
Prof. dr hab. Wojciech Bal, IBB PAN
ZOOM meetings on Mondays, 09.00 to 12.00
Lectures are scheduled for: March 1, 8, 15, 22, April 12, 19, 26, May 10, 17, 24
Link is available at Students Portal
Biologically Active Peptides
room E, 09:00 am
March 2, 2020
Dr Arkadiusz Bonna
"Introduction to Amino Acids and Peptides."
March 9, 2020
Dr Tomasz Frączyk
"Peptides Activity Studies – General Methods."
March 16, 2020
Dr Arkadiusz Bonna
"Peptide-Protein TANGO” – Prediction of Sequence-Dependent Effect on the Aggregation
of Peptides and Proteins, and its consequences."
March 23, 2020
Dr hab. Simon Drew, IBB PAS
"Peptides in Neurodegenerative Diseases."
March 30, 2020
Dr Monika Wojciechowska, CeNT
"Peptide Nucleic Acids (PNA)."
April 6, 2020
Prof Adam Lesner, University of Gdańsk
"Conjugate Peptides as Novel Therapeutic Agents for Sepsis. Bladder cancer detection using a peptide. Design of Substrates Spanning Primed Positions of Zica Virus Protease."
April 20, 2020
Dr Tomasz Frączyk
"Peptide Modifications"
April 28, 2020 (Tuesday)
Prof Silvia Marchesan, University of Trieste
"Chirality and Self-assembled Peptides."
Biophysics for Biologists (B4B),
room E, 09:00
Structure and organization of matter - basic information
1. 8.10.2018
Andrzej Dziembowski, IBB PAS/University of Warsaw
Biophysical analysis of biological macromolecules starts with the biochemistry– an introduction
2. 15.10.2018
Jarosław Poznański, IBB PAS
Without a basic knowledge about properties of macromolecules, a biologist will be unable to conduct a biophysical experiment – an introduction
Optical methods:
3. 22.10.2018
Wojciech Bal, IBB PAS
• What's there between physics and biology?
• UV-VIS and CD spectroscopy in biology
4. 5.11.2018
Jacek Waluk, IFCh PAS
Fluorescence, Raman, and IR spectroscopies
Thermodynamic methods:
5. 19.11.2018
Tomasz Frączyk, Medical University of Warsaw
Isothermal titration calorimetry (ITC) and differential scanning calorimetry (DSC)
6. 26.11.2018
Jaroslaw Poznanski, IBB PAS
Thermal shift assay (former DSF - Differential Scanning Fluorimetry) and Microscale thermophoresis (MST) – fast and efficient methods for screening intermolecular interactions
7. 3.12.2018
Krzysztof Skowronek, IICMB, Warsaw
Surface Plasmon Resonance. Real-time stain-free interaction analysis
Structural methods:
8. 10.12.2018
Honorata Czapinska / Matthias Bochtler, IICMB/IBB PAS, Warsaw
Macromolecular crystallography
9. 17.12.2018
Konrad Zdanowski, IBB PAS/University of Natural Sciences and Humanities, Siedlce
Adventures with NMR spectroscopy of proteins and smaller molecules
10. 7.01.2019
Simon Drew, IBB PAS/University of Melbourne
Electron paramagnetic resonance – Principles and applications to chemical and biological systems
11. 14.01.2019
Marcin Nowotny, IICMB, Warsaw
Cryo-electron microscopy - revolution in structural biology
12. 21.01.2019
Michał Dadlez, IBB PAS
Mass spectrometry in structure and dynamics studies of proteins and their complexes
13. 28.01.2019
Maciej Kozak, UAM Poznan
Applications of SAXS in biophysics and structural biology
14. 11.02.2019
Piotr Zielenkiewicz, IBB PAS
Molecular modeling
15. 18.02.2019
Małgorzata Lichocka, IBB PAS
Imaging Molecular Interactions in Living Cells
Applied Molecular Biology, room E, 09:00
19.03.2018
Magdalena Kowalczyk, Jacek Bardowski, Agnieszka Szczepankowska
Lactic acid bacteria - from basic research to innovative applications.
9.04.2018
Róża Kucharczyk
ATP synthase defects in diseases – what we have learnt from yeast model
16.04.2018
Barbara Tudek
Molecular markers for cancer diagnosis and selection of anticancer therapy
23.04.2018
Magdalena Krzymowska, Jacek Hennig
Molecular breeding
14.05.2018
Jan Gawor
Advances in genome sequencing technologies
21.05.2018
Mirosław Tyrka
Next Generation Sequencing technologies for gene discovery
28.05.2018
Beata Burzyńska
Transcriptomic biomarkers of cardiovascular disease
4.06.2018
Małgorzata Łobocka
Progress in the engineering of bacterial and bacteriophage genomes and in the construction of artificial life
Exam planned on June 11, 2018, hall E
Program wykładów semestr zimowy 2017/2018
„Biologia molekularna eukariontów – nowe odkrycia i trendy badawcze”
sala E, godz. 9:00
Temat | Osoba prowadząca | data |
Dynamika struktury chromatyny: modyfikacje histonów | Dr hab. Marta Koblowska | 02.10.2017 |
Dynamika struktury chromatyny: kompleksy remodulujące | Dr hab. Tomasz Sarnowski | 09.10.2017 |
Replikacja DNA/cykl komórkowy | Prof. Iwona Fijałkowska/Dr Michał Dmowski/ Dr Karolina Makieła-Dzbeńska | 16.10.2017 |
Stabilność genomu, reperacja DNA | Dr hab. Adrianna Skoneczna | 23.10.2017 |
Transkrypcja z udziałem Pol II; mRNA versus lncRNA | Dr Szymon Świeżewski | 06.11.2017 |
Splicing mRNA | Prof. Magda Konarska | 13.11.2017 |
Transkrypcja z udziałem Pol III, procesowanie tRNA | Prof. Magdalena Boguta/ Dr Damian Graczyk | 20.11.2017 |
Inne RNA, transkrypcja i procesowanie | Prof. Joanna Kufel | 27.11.2017 |
Małe regulatorowe RNA | Prof. Andrzej Dziembowski | 04.12.2017 |
Trwałość RNA | Prof. Andrzej Dziembowski | 11.12.2017 |
Translacja białek | Prof. Marek Tchórzewski | 08.01.2017 |
Ubikwitynacja i degradacja białek | Prof. Teresa Żołądek | 15.01.2017 |
Autofagia | Prof. Agnieszka Sirko | 22.01.2017 |
Transport białek w komórce | Dr Joanna Kamińska | 29.01.2017 |
Fosforylacja białek | Prof. Grażyna Dobrowolska | 05.02.2017
|
Inne modyfikacje postranslacyjne białek - lipidacja | Prof. Ewa Świeżewska/Dr Małgorzata Gutkowska-Stronkowska | 12.02.2017 |
Cykl wykładów zakończy sie egzaminem
Program wykładów semestr zimowy 2016/2017
„Patologia molekularna wybranych chorób genetycznie uwarunkowanych”
(Zakład Genetyki Medycznej Instytutu Matki i Dziecka)
Wykłady odbędą się w sali E, godz. 10:00
| Temat | Osoba prowadząca | Liczba godzin | data |
| Test genetyczny | Prof. J. Bal | 1 | 17.10.16 |
| Znaczenie diagnostyki chorób genetycznych oraz poradnictwa genetycznego we współczesnej medycynie | Dr E. Obersztyn | 1 | 17.10.16 |
| Zasady i metody klasycznej i molekularnej diagnostyki cytogenetycznej | Dr B. Nowakowska | 2 | 24.10.16 |
| Zespoły chorobowe zależne od aberracji lub niestabilności chromosomów | Dr B. Nowakowska | 2 | 07.11.16 |
| Diagnostyka molekularna chorób dziedzicznych - metody i interpretacja wyników badań | Dr M. Gos | 2 | 14.11.16 |
| Mukowiscydoza – modelowa choroba dziedziczna | Mgr D. Śniegórska | 1 | 21.11.16 |
| Aspekty genetyczne dziedzicznej postaci głuchoty | Mgr K. Niepokój | 1 | 21.11.16 |
| Jedna choroba wiele genów – RASopatie jako przykład heterogenności genetycznej | Dr M. Gos | 2 | 28.11.16 |
| Jeden gen trzy fenoptypy – mutacja dynamiczna w genie FMR1 | Dr S. Rzońca | 2 | 05.12.16 |
| Wielogenowe podłoże genodermatoz na przykładzie Epidermolisis bullosa – choroby „dzieci motyli”. Od diagnostyki do terapii | Dr K. Wertheim-Tysarowska | 2 | 12.12.16 |
| Rola rodzicielskiego piętna genomowego w etiopatogenezie chorób genetycznie uwarunkowanych. | Dr M. Gos | 2 | 19.12.16 |
| Rekombinacja niehomologiczna jako przyczyna rdzeniowego zaniku mięśni | Dr M. Gos | 1 | 09.01.17 |
| Poszukiwanie, przy zastosowaniu technik molekularnych, genów i ich wariantów odpowiedzialnych za wystąpienie wad migracji neuronalnych | Dr. P. Gawliński | 1 | 09.01.17 |
| Niepełnosprawność intelektualna – stan badań a możliwości diagnostyki molekularnej | Dr A. Charzewska | 2 | 16.01.17 |
| Zespoły padaczkowe. Geneza podłoże molekularne | Dr D. Hoffman-Zacharska | 1 | 23.01.17 |
| Choroby neurodegeracyjne o późnym wieku zachorowania | Dr D. Hoffman-Zacharska | 1 | 23.01.17 |
| Problemy etyczne diagnostyki chorób genetycznych | Dr D. Hoffman-Zacharska | 1 | 30.01.17 |
Test z wykładów - 30.01.2017
Materiały do wykładów:
b) Zespół łamliwego chromosomu X
d) Pęcherzowe odrdzielanie się naskórka
j) Piętnowanie
k) Rasopatie
l) Aspekty genetyczne dziedzicznej postaci niedosłuchu
m) Rekombinacja niehomologiczna jako przyczyna rdzeniowego zaniku mięśni
n) Analiza genetyczna dziedzicznych chorób metabolicznych
o) Niepełnosprawność intelektualna
Wykłady, 2015/2016
Semestr letni:
22.01.2016, godz. 16:00 sala 7 - Prof. dr hab. J.M. Bujnicki "Computational modeling of protein and RNA structures"
07.03.2016, godz. 13:00, MIBMiK - Prof. Agnieszka Chacinska
21.03.2016, godz. 13:00, MIBMiK - Dr hab. Marcin Nowotny - "CRISPR - mechanism and applications"
04.04.2016, godz. 13:00, MIBMiK - Prof. Jacek Kuznicki - "Calcium in health and brain diseases - part 1"
11.04.2016, godz. 13:00, MIBMiK - Prof. Jacek Kuznicki - "Calcium in health and brain diseases - part 2"
18.04.2016, godz. 13:00, MIBMiK prof. Jacek Jaworski - "Cytoskeleton dynamics and cytoskeleton based transport"
25.04.2016, godz. 13:00, MIBMiK - prof. Jacek Jaworski - "Cytoskeleton dynamics and cytoskeleton based transport"
09.05.2016, godz. 13:00, MIBMiK - Prof. Marta Miaczynska - "Basic principles of intracellular membrane trafficking"
16.05.2016, godz. 13:00, MIBMiK - Prof. Marta Miaczynska - "Endocytosis: mechanisms and functions"
23.05.2016, godz. 13:00, MIBMiK - Marcin Nowotny - "Modern methods of single particle electron microscopy"
Semest zimowy
"Introduction to macro-molecular crystallography "
Prowadzący prof. Matthias Bochtler
November 16th, 9:30 Introduction to high resolution structure determination methods, diffraction based methods in particular
November 16th, 10:30 Crystal growth, crystal symmetry, Bravais lattices, space groups
November 23rd, 9:30 Diffraction physics, determining Bravais lattice and space group from diffraction data
November 23rd, 10:30 Data integration and scaling
November 30th, 9:30 Reciprocal space, Fourier transforms, experimental phasing
November 30th, 10:30: Molecular replacement
December 14th, 9:30 Model building and refinement
December 14th, 10:30 Data validation, data deposition
"Zastosowanie sekwencjonowań nowej generacji w badaniach naukowych"
czas trwania: poniedziałek 25.05.-22.06.2015
Sala E
1. Mgr Jan Gawor - "Strategie sekwencjonowania małych genomów" (25.05.2015, g.12:00)
2. Dr Rafał Archacki - "Real-time PCR" (01.06.2015, g.12:00)
3. Mgr Anna Fogtman IBB PAN - "RNA-seq, ChIP-seq" (08.06.2015, g. 12:30)
3. Dr Bartłomiej Wilczynski - "Analiza danych z Sekwencjonowania RNA-seq" (15.06.2015, g. 11:30)
4. Dr Bartłomiej Wilczynski - "Analiza danych z Chipseq" (22.06.2015, g.12:00)
"Bioenergetyka komórki ssaczej"
czas trwania: poniedziałek 09.03.-27.04.2015
Sala E, godz. 12:00
Program wykładów:
1. Profesor Lech Wojtczak - „Historia badan nad mitochondriami, struktura mitochondriów i oksydacyjna fosforylacja”,
2. Dr hab. Joanna Szczepanowska - „Stres mitochondrialny w starzeniu i chorobach neurodegeneracyjnych”,
3. Dr hab Mariusz Wieckowski - "Oddzialywania mitochondriów z innymi strukturami wewnątrzkomorkowymi i rola tych oddzialywan w przekazywaniu sygnału”,
4. Dr Magdalena Lebiedzinska-Arciszewska - „ Apoptoza i mitoptoza”.
5. Dr Michal Wasilewski - "Biogeneza i homeostaza mitochondriów"
6. Profesor Agnieszka Chacinska - "Mitochondria jako centra komunikacyjne"
Metody wielkoskalowe (genomiczne, transkryptomiczne i proteomiczne) w badaniach podstawowych i aplikacyjnych
Czas trwania: poniedziałek od 13.10.2014 do 01.12.2014
Sala E, godz. 14:00
Instytut Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk
Pawińskiego 5a, 02-106 Warszawa, Polska
Centrala: +48 22 / 659 70 72 | Login
